En la actualidad, Manel Villalante es el director general de Desarrollo y Estrategia de Renfe, Presidente de la operadora checa Leo Express y CEO de Renfe of America. Además, preside el Foro Global de Viajeros (Global Passengers Forum) de la UIC y desde Julio de 2023, ocupa la presidencia del cluster In-Move.

Anteriormente fue director de Movilidad e Infraestructuras del Transporte en Barcelona Regional Agencia de Desarrollo Urbano (2012-2018), director general de Transporte Terrestre del Ministerio de Fomento (2010-2012), director general de Transporte Terrestre de la Generalitat de Catalunya (2007-2010), director de Movilidad del Ayuntamiento de Barcelona (1991-1997) y ha ocupado diferentes cargos directivos en Ferrocarriles de la Generalitat de Catalunya (FGC) entre 2004 y 2007, y en Transportes Metropolitanos de Barcelona (TMB), entre 2000 y 2004. 

Ha sido igualmente miembro de diferentes Consejos de Administración, en compañías como Renfe Operadora, TMB, FGC o el Consorcio Sagrera Alta Velocidad. 

En el ámbito académico, dirige actualmente el Postgrado en ‘Smart Mobility: Sistemas Inteligentes de Transporte’ en la Universidad Politécnica de Catalunya y ha sido profesor de Planificación y Economía del Transporte en la misma universidad.